《表3 候选区段内的基因预测》

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《基于极端个体GBS测序初步定位西瓜果形基因》


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将参考基因组“97103”中3号染色体26.80~27.33 Mb区域内的序列在葫芦科作物基因组数据库(http://cucurbitgenomics.org)中的Genome Browser进行基因预测,发现该区间共有41个基因,其中有5个未知蛋白(表3)。通过比对该区间SNPs分布情况,发现有15个基因上不存在SNPs,有7个基因上的SNPs存在于基因的间隔区或内含子区,有14个基因的外显子区域存在SNPs的基因。