《表5 核心启动子区预测结果》

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《PPP3CA基因多态性与江口萝卜猪肉质性能关联性分析》


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PPP3CA基因调控序列的核心启动子区预测结果如表5,2种软件分别预测到2个可能的核心启动子区,A-918C位点位于Promoter2.0预测到的一个核心启动子区附近,且该处预测结果评分较高,说明A-918C位点的变异可能会对PPP3CA基因启动子的功能产生影响。采用2种软件预测A-918C位点变异前后PPP3CA基因启动子区转录因子结合位点(表6),2种软件预测结果基本一致,A-918C位点变异会导致2个转录因子结合位点的消失和2个转录因子结合位点的产生,转录因子结合位点总数不改变。采用3种软件进行启动子区Cp G岛预测(表7),3种软件均在PPP3CA基因启动子区预测到了不同大小的Cp G岛,但A-918C位点均不在预测到的Cp G岛内,说明该位点影响启动子区甲基化水平的可能较小。