《表3 SNP位点数量概况》

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《基于转录组测序的方斑东风螺单核苷酸多态性位点挖掘及功能注释》

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利用在对照组转录组（BLANK）和实验组转录组（LPS-4h，LPS-8h）获得的数据，经SOAPsnp软件检测，从37 136、37 076、36 657条unigenes中分别获得224 055、225 287、224 440个SNP位点，所有SNP位点中，纯合SNP位点107 407个（BLANK组35 635个，LPS-4h组35 543个，LPS-8h组36 229个）（表3）。对于Unigene上的SNP位点分析统计发现，BLANK转录组中含1个SNP位点的unigene有9 802条（26.39%），含2～10个SNP位点的unigene 21 224条（57.15%），含10个以上SNP位点的unigene 6 110条（16.45%)；LPS-4h转录组中含有1个SNP位点的unigene有9 721条（26.22%），含2～10个SNP位点的unigene 21 224条（57.19%），含10个以上SNP位点的unigene 6 110条（16.59%)；LPS-8h转录组中含1个SNP位点的unigene有9 580条（26.13%），含2～10个SNP位点的unigene 20 921条（57.07%），含10个以上SNP位点的unigene 6 156条（16.79%）（图1）。