《表3 3个SNP位点之间的连锁不平衡参数估计》

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《从江香猪SIM1基因SNP位点遗传效应分析》


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利用SHEsis在线软件对SIM1基因3个多态位点进行连锁不平衡参数估计及单倍型构建,见表3和表4,结果表明,r2和D'大于0,说明3个多态位点间分别处于连锁不平衡状态。可构建7种单倍型,即:M-C-G、M-C-A、M-T-A、N-C-A、M-T-G、N-T-A、N-C-G;分别命名为H1、H2、H3、H4、H5、H6、H7,其频率分别为39.3%、28.2%、13.0%、8.1%、7.2%、3.4%、0.7%。