《表3 三穗鸭ATF4基因3个SNPs位点的连锁不平衡分析结果》

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《三穗鸭ATF4基因多态性鉴定及其与蛋壳品质的关联分析》


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表格右上角为D’,表格左下角为γ2

D’和γ2是常用于衡量连锁不平衡的2个重要参数,其中,区域内重组事件发生连锁不平衡的概率通过D’反映,而连锁分析通过γ2反映(Mayo,2008)。当D’>0.8时,表明SNP位点间强连锁且不平衡,当γ2>0.330时,表明SNP位点间紧密连锁且趋向于一个整体遗传(Ardlie et al.,2002;Slatkin,2008)。由表3可知,g.2667A>G位点与g.2571A>G位点间的D’为1.0,大于0.8,且γ2为0.665,大于0.330,可确定这2个位点间处于强连锁不平衡状态,即g.2667A>G位点和g.2571A>G位点为高度连锁,趋向整体遗传;g.2394G>A位点与g.2571A>G位点间的D’为1.0,大于0.8,且γ2为0.347,大于0.330,可确定这2个位点间存在强连锁不平衡状态;g.2667A>G位点与g.2394G>A位点间的D’为1.0,大于0.8,但γ2为0.227,小于0.330,说明这2个位点间不存在强连锁不平衡。