《表3 12个与红叶性状相关的SNP位点》

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《基于全基因组重测序技术的‘红叶’杜仲SNP位点开发》

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根据基因功能注释的5大数据库结果，26 722条含有差异位点的基因中共有228条基因注释到与花色苷和类黄酮合成相关。228条基因内部共有829个差异位点，根据SnpEff注释，46个位点严重影响蛋白质结构，783个位点中度影响蛋白质功能。与参考基因组比，‘红叶’杜仲中存在的这228条基因，含有27个位点严重影响蛋白质结构，其中有15个纯合位点；有556个位点中度影响蛋白质结构，269个纯合位点。经过最终筛选，得到12个位点在‘红叶’杜仲中完全差异于参考基因组，且‘小叶’杜仲中的这12个位点与参考基因组一致，测序深度均≥10×（表3）。这12个位点分布在6条基因的内部（表4）。