《表2 杜仲重测序的KEGG代谢途径分类图》

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《基于全基因组重测序技术的‘红叶’杜仲SNP位点开发》

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含有变异位点的26 722基因，在Nr数据库注释到13 408条基因，在Uniport中注释到14 418条基因，在GO数据库中注释到21 453条基因，在EggNOG数据库中注释22 660条基因，在KEGG数据库中注释到5 915条基因。为了进一步研究含有突变位点的基因功能，向GO数据库的各个term进行映射（图1），发现在细胞组分（cellular component）中注释到核、细胞质、膜的有机组成部分，在生物进程（biological process）中注释到等离子体膜，在分子功能（molecular function）中注释到蛋白结合、线粒体和叶绿体、ATP结合及转录过程。根据KEGG注释信息，如表2所示，含有差异位点的基因可注释到286条代谢途径，其中较多的是淀粉和蔗糖代谢，苯丙素生物合成途径等，与植物叶片生长及颜色密切相关。利用EggNOG数据库对比分析，如图2所示，有12 977个位点注释到25个类别，其中信号转导机制（1 220，9.38%）、转录（868，6.68%）、蛋白质翻译后修饰与转运、分子伴侣（838，6.45%）碳水化合物的运输和代谢（801，6.16%）等类别注释到的变异位点多，其次是能量产生和转换（527，4.05%），次生代谢产物的生物合成、转运和分解代谢（456，3.51%）。