《表4 不同样本差异表达基因的代谢途径KEGG富集分析》

《表4 不同样本差异表达基因的代谢途径KEGG富集分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《水分胁迫下马铃薯萌芽出苗期根系转录组差异表达分析》


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通过代谢途径KEGG富集分析,确定‘克新1号’马铃薯在萌芽出苗期受到不同程度水分胁迫后,差异表达基因所参与的主要生物代谢途径和信号转导途径,结果(见表4)表明,在DLWR(重度水分胁迫)中,有2 532个差异表达基因注释到KEGG数据库中的116个分类代谢途径,显著富集的有6个通路,上调表达基因出现在谷胱甘肽代谢(sot00480)和植物激素信号转导(sot04075)2个途径.在谷胱甘肽代谢途径中关键酶亮氨酸氨肽酶(PepA)表达量增加,增加了谷胱甘肽的合成量;从谷胱甘肽向R-S-谷胱甘肽转移过程中,谷胱甘肽硫转移酶的相关基因PGSC0003DMG402011367、PGSC0003DMG400011012、PGSC0003DMG400002174、PGSC0003DMG400014654、PGSC0003DMG400031094、PGSC0003DMG400002169、PGSC0003DMG400002171、PGSC0003DMG400002172、PGSC0003DMG400031092等均呈下调表达,减缓了还原型谷胱甘肽向氧化型谷胱甘肽的转换速度.还原型谷胱甘肽具有清除因逆境引起的细胞内产生自由基的功能,可提高植株抗逆性.在植物激素信号转导过程中,与生长素(IAA)转入蛋白(AUX1)基因、生长素响应基因AUX/IAA、ARF、GH3相关的基因表达量均下调,说明IAA信号转导途径被抑制,重度水分胁迫抑制了根系的生长发育,与脱落酸(ABA)信号转导核心组分PP2C、SnRK2、ABF相关基因表达量上调,ABA信号转导参与逆境胁迫的正调控.在LWR(中度水分胁迫)中,有709个差异表达基因注释到KEGG数据库中的94个分类代谢途径,显著富集的也有6个通路,其中上调表达的基因出现在亚油酸代谢(sot00591)、次生代谢产物的生物合成(sot01110)、淀粉和蔗糖代谢(sot00500)3个途径,次生代谢产物是植物体内重要的抗氧化物质,能够减轻因逆境引起的活性氧伤害.在不同程度水分胁迫下,下调表达基因均出现在苯丙素生物合成(sot00940)、苯丙氨酸代谢(sot00360)和植物病原体相互作用(sot04626)3个途径,苯丙素生物合成和苯丙氨酸代谢均属于次生代谢产物生物合成,说明水分胁迫逆境对马铃薯根系的生长发育造成一定程度的伤害.