《表2 ddPCR引物/探针序列》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《水产品中创伤弧菌ddPCR定量方法的建立》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

注：a.引物/探针位置分别参考GenBank no.AY187681.1(nplD、rpoS基因）、AY626581.1(vcgE基因）和U50548.1(met基因）序列信息。

为实现对创伤弧菌的特异性检测和绝对定量分析，分别选取创伤弧菌具有种属特异性且高度保守的单拷贝脂蛋白D基因（nplD，GenBank no.AY187681.1）、RNA聚合酶亚单位σ因子S基因（rpoS，GenBank no.AY187681.1）、毒力相关基因E(vcgE，GenBank no.AY626581.1）和金属蛋白酶基因（met，GenBank no.U50548.1）作为靶序列，通过NCBI在线工具进行序列分析和比对，利用Prime Express软件V3.0(ABI，Foster City，CA，USA）设计出4对引物和探针组合，序列见表2。探针5’端标记FAM，3’端标记BHQ。引物/探针均由生工生物工程（上海）股份有限公司合成。分别利用real-time PCR和ddPCR对创伤弧菌（ATCC 27562）基因组DNA进行检测，比较4组引物探针的荧光信号，并利用表2菌株验证所筛选引物探针的特异性。