《表4 菠萝酸性转化酶基序氨基酸序列及功能》

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《菠萝酸性转化酶基因家族初步生物信息学及表达分析》

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基因结构分析结果表明，菠萝的Ac AINs基因结构均由外显子和内含子组成，Ac CWIN1和Ac VIN1均有5个内含子，Ac CWIN2含有3个内含子，而Ac VIN2含有6个内含子（图2）。与模式植物水稻、番茄及其他植物AINs蛋白序列的系统进化树分析结果表明，Ac CWIN1、Ac CWIN2和Ac VIN1、Ac VIN2分别与其他植物的细胞壁酸性转化酶蛋白和液泡酸性转化酶蛋白聚类在一起（图3）。NCBI在线CDD分析结果发现，Ac CWIN1和Ac CWIN2均只含有1个Glyco＿32结构域，而Ac VIN1和Ac VIN2除含有Glyco＿32结构域外，在其N端还含有1个功能未知的DUF3357结构域，说明该家族基因属于糖基水解酶基因家族GH32（图4）。菠萝Ac AINs蛋白保守基序MEME预测结果如图5所示，基序分析中，4个Ac AINs蛋白的5个保守基序位置和序列均较为相似，并利用SMART和Pfam对预测的保守基序进行命名（表4）。