《表1 RAA检测人鼻病毒通用型引物和探针信息》
注:修饰方法:FAM:6-羧基荧光素;THF:四氢呋喃;BHQ:黑洞淬灭剂;磷酸盐:3'端磷酸盐来终止延伸。
经过NCBI数据库中人鼻病毒基因序列比对,采用RAA技术引物及探针设计原则进行的设计,共设计了3对探针和引物,通过筛选和评价(图1),确定上游引物、下游引物。根据仪器检测荧光的性能,以及探针的修饰方法优选原则:荧光报告基团修饰在探针序列离5'端碱基数14 bp的位置上;荧光淬灭基团修饰在探针序列离3'端碱基数29 bp的位置上,荧光报告基团与淬灭基团之间间隔3个碱基GAC,其中碱基A用四氢呋喃残基替换;经过修饰的探针确定(表1)。
图表编号 | XD00203246000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.10 |
作者 | 陈淑丹、张小平、李杰、朱璇、郑伟、郭利川 |
绘制单位 | 杭州国际旅行卫生保健中心(杭州海关口岸门诊部)、杭州萧山机场海关、台州海关、杭州国际旅行卫生保健中心(杭州海关口岸门诊部)、杭州国际旅行卫生保健中心(杭州海关口岸门诊部)、江苏奇天基因生物科技有限公司 |
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