《表2 SARS-Co V-2 RBD结合p ACE2、h ACE2和c ACE2的结构比较a)》

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《新型冠状病毒结合穿山甲ACE2受体的分子机制》

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a) SARS-CoV-2 RBD氨基酸括号内的数字表示与pACE2（前者）、hACE2（中间）和cACE2（后者）形成的范德华力和氢键相互作用数量.ACE2氨基酸括号中的数字表示与SARS-CoV-2 RBD形成的范德华力和氢键相互作用数量.逗号后的数字表示形成的氢键相互作用数量.上述分析的范德华力距离为4以内，

进一步比较3个复合物结构的相互作用细节发现，除D405和F490外，SARS-Co V-2 RBD与p ACE2相互作用的其余氨基酸均与h ACE2相同（表1）.D405与p ACE2的H354形成1个相互作用，而与h ACE2没有相互作用；F490与h ACE2形成1个相互作用，而与p ACE2没有相互作用.与结合c ACE2相比，SARS-Co V-2 RBD与p ACE2相互作用的氨基酸有5个不同，分别为D405、Y473、A475、G476和S477 （表2），D405同样与c ACE2也没有相互作用，而与p ACE2形成1个相互作用；Y473与c ACE2形成1个相互作用，S477与c ACE2形成氢键，而二者与p ACE2没有相互作用；A475和G476与p ACE2分别形成偶极相互作用和氢键，而与c ACE2没有相互作用.虽然SARS-Co V-2 RBD与p ACE2、h ACE2和c ACE2相互作用的氨基酸略有不同，但参与相互作用的氨基酸总数是相近的，分别为19、19和18.SARS-Co V-2 RBD与p ACE2、h ACE2和c ACE2相互作用界面的面积分别为913.8、876.8和960.2?2，虽然其与h ACE2相互作用界面的面积最小，但是二者之间的范德华力和氢键相互作用略多于p ACE2和c ACE2（分别为124、141和143、11、13和11）（表2）.值得注意的是，由于SARS-Co V-2 RBD的K417与p ACE2的E30距离变远，失去了氢键相互作用，进而导致其与p ACE2的E30相互作用弱于h ACE2的D30和c ACE2的E30（表2）.这些结果提示SARS-Co V-2 RBD与p ACE2的作用力低于h ACE2，这与SPR结果相符.通过比较SARS-Co V-2 RBD结合p ACE2、h ACE2和c ACE2的足迹，发现参与相互作用的大部分氨基酸在3种ACE2s中是保守的，而p ACE2和h ACE2仅有1个氨基酸不同（图3(e），（f）)，p ACE2和c ACE2有7个氨基酸的差异（图3(e），（g）).这些结果表明，相比于SARS-Co V-2 RBD-c ACE2复合物结构，SARS-Co V-2 RBD-p ACE2更相似于SARS-Co V-2 RBD-hACE2.