《表1 SARS-Co V-2 RBD与p ACE2复合物晶体结构数据收集和修正参数统计表》
a)括号中的数据表示最高分辨率范围
为收集晶体衍射数据,将晶体快速冻至含有20%(v/v)甘油的防冻液中,并转移至液氮罐中.在上海同步辐射光源BL17U线站收集p ACE2-SARS-Co V-2 RBD复合物晶体X射线衍射数据.使用HKL2000[21]对收集的数据进行初步处理,以先前报道的h ACE2-SARS-Co V-2RBD复合物结构(PDB:6LZG)为模型,利用Phaser[22]分子置换法解析p ACE2-SARS-Co V-2 RBD复合物结构,使用COOT[23]建立原始模型,并用Phenix[24]对模型进行修正,用Mol Probity[25]评估最终模型的立体化学质量.表1总结了晶体数据收集、处理和修正参数,使用Py MOL软件进行结构分析并作图(https://www.pymol.org/).本研究获得的SARS-Co V-2 RBD与p ACE2的复合物晶体结构已在蛋白数据库(Protein Data Bank,PDB)中注册登记,其注册号为7DHX,同时也在国家微生物科学数据中心(National Microbiology Data Center,NMDC)中注册登记,其注册号为NMDCS0000010.
图表编号 | XD00200895600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.10 |
作者 | 仵丽丽、苏佳岐、牛胜、陈茜、张艳芳、严景华、施一、齐建勋、高福、王奇慧 |
绘制单位 | 中国科学院微生物研究所微生物生理与代谢工程重点实验室、中国科学院大学、中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫学重点实验室、中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫学重点实验室、山西农业大学动物科技学院、中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫学重点实验室、安徽大学物理科学与信息学院、中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫学重点实验室、中国科学院微生物研究所微生物生理与代谢工程重点实验室、中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫学重点实验室、中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫学重点实验室、中国科学院微生物研究 |
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