《表1 人参根系差异蛋白的第二层GO功能分类》

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《化感胁迫下人参根系差异蛋白表达分析》

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为了深入了解蛋白功能，我们对GO分类结果做进一步二级分类作图（FDR<0.05），分为生物学过程（biological process，BP）、细胞组分（cellular component，CC）、分子功能（molecular function，MF）三类（表1）。在生物学过程中，二级分类作图显示具有显著统计学意义的分别为次生代谢物生物合成过程分类包含80个蛋白、单生物过程（分类包含70个蛋白；类黄酮代谢过程分类包含62个蛋白；糖醛酸代谢过程分类包含50个蛋白；对刺激的反应分类包含56个蛋白；防御反应分类包含34个蛋白）等。细胞组成中，二级分类作图显示具有显著统计学意义的分别为线粒体分类，包含86个蛋白；细胞内膜结合细胞器分类包含86个蛋白；细胞部分分类包含78个蛋白；细胞内膜结合细胞器分类包含62个蛋白；过氧化物酶体分类包含38个蛋白；植物型液泡分类包含38个蛋白；叶绿体类囊体分类包含26个蛋白等。