《表1 差异蛋白GO富集统计》

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《苹果片在干制条件下的蛋白质组学分析》


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Gene Ontology显著性富集分析以GO term为单位,找出与基因组的所有表达基因背景相比,在差异表达基因中显著性富集的GO term。检验P值,将用P≤0.05的GO term定义为在差异表达基因中显著富集的GO term。通过GO功能显著性富集分析能确定差异表达基因行驶的主要生物学功能。其中BP为biological process(生物学过程)、MF为Molecular Function(分子功能)、CC为Cellular Component(细胞组件)。用GO数据库注释将差异蛋白,分析差异蛋白在本体论水平上的功能富集,结果显示,差异蛋白分别在Biological process、Cellular component和Molecular function这3个水平上有显著富集。其中差异蛋白表达数≥10的有催化活性catalytic activity(48个差异表达蛋白)、氧化还原过程oxidation-reduction process(18个差异表达蛋白)、应激反应response to stress(17个差异表达蛋白)、碳水化合物代谢过程carbohydrate metabolic process(13个差异表达蛋白)、羧酸代谢过程carboxylic acid metabolic process(11个差异表达蛋白)、酮酸代谢过程oxoacid metabolic process(11个差异表达蛋白)、有机酸代谢过程organic acid metabolic process(11个差异表达蛋白)、非生物刺激反应response to abiotic stimulus(10个差异表达蛋白)。通过注释信息可知在果肉干制过程中代谢活力整体上功能集中在催化过程和氧化还原过程(表1、图1)。