《表2 差异基因GO功能分类》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《水稻单基因系品种IRBL9-W抗瘟初期基因表达谱分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

对差异基因进行GO功能注释分类，结果显示主要包括细胞组分（cellular component）、生物过程（biological process）、和分子功能（molecular function） 3个大类22个亚类（表2）。在细胞组分大类中，细胞、大分子复合物及细胞器等亚类中富集较高；在分子功能大类中，结合和催化活性亚类中富集较高；在生物过程大类中，细胞过程和代谢过程亚类中富集较高。其中代谢过程、催化活性、结合等功能分类中涉及的基因数最多，但这基因产物也不具有直接抑菌作用。虽然抗氧化功能基因在参与抗病过程中起到重要的作用，由表2也可以发现具抗氧化活性的基因的上调表达比例较高，但本结果仅能证明水稻本身已产生氧化活性物质，而这些具抗氧化活性的基因主要在清除氧化物过程起到关键的作用，其主要目的是保护细胞免除氧化物的伤害，并未直接参与抑菌。在植物抗病过程中转录调控因子同样起到关键的作用，本研究中4个亮氨酸拉链基因中3个（LOC＿Os04g46350.1，LOC＿Os03g07450.1，LOC＿Os12g40920.4）上调表达，1个（LOC＿Os07g44950.1）下调表达；锌指蛋白基因1个（LOC＿Os06g37450.1）上调表达；16个WRKY蛋白家族基因（LOC＿Os01g43650.1，LOC＿Os01g47560.1，LOC＿Os01g54600.1，LOC＿Os01g60600.1，LOC＿Os09g25060.1，LOC＿Os09g25070.2，LOC＿Os06g06360.1，LOC＿Os06g44010.1，LOC＿Os06g05380.1，LOC＿Os12g02440.4，LOC＿Os05g09020.1，LOC＿Os05g46020.1，LOC＿Os05g50610.1，LOC＿Os05g50610.2，LOC＿Os05g39720.1，LOC＿Os11g29870.1）全部下调表达，这些转录调控因子可能参与水稻抗稻瘟病菌过程，但转录调控因子只是抗病过程中的调控阶段。在植物中对真菌具有直接抑制及抗菌作用的真菌细胞壁降解酶主要为几丁质酶与β-1，3葡聚糖酶，根据功能分类本研究共检测几丁质酶与β-1，3葡聚糖酶的表达基因共计49个，其中几丁质酶类基因40个，β-1，3葡聚糖酶类基因9个，在两类酶基因中存在差异表达的基因12个，其中几丁质酶类基因10个（LOC＿Os08g41100.1，LOC＿Os04g41640.1，LOC＿Os04g41680.1，LOC＿Os04g41620.1，LOC＿Os01g64100.1，LOC＿Os01g64110.1，LOC＿Os02g39330.1，LOC＿Os09g32080.2，LOC＿Os06g24990.1，LOC＿Os06g25010.1），β-1，3葡聚糖酶类基因2个（LOC＿Os01g71890.1，LOC＿Os05g41610.1），除了2个几丁质酶类基因（LOC＿Os08g41100.1，LOC＿Os09g32080.2）上调表达外，其他10个细胞壁降解酶基因全部下调表达，其结果说明上调表达的2个几丁质酶类基因可能参与水稻抗稻瘟菌过程，但仅靠2个几丁质酶并无法实现水稻对稻瘟病菌免疫。由于以上已知基因产物并不能完全抑制稻瘟病菌侵染，因此进一步分析差异表达基因产物在相应信号通路中所调控的化合物才是关键。