《表2 HCD谱图数据集局部准确性》
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《蛋白质组串联谱图De novo测序软件的比较与评估》
考虑到Pep Novo+给出的序列较短,为进一步考察测序结果的局部准确性,本研究统计了测序序列与真实序列的公共子序列的长度,最长子序列越长、肽段数量越多,则代表测序结果的局部准确性越高。在CID谱图中,Novor和Pep Novo+的测序结果与真实序列均有着大量较长的公共子序列,最长公共子序列长度为8 aa及以上的谱图数约占鉴定谱图数的30%,说明这两种软件的测序结果具有较高的局部准确性;p Novo3中具有8 aa及以上长度公共子序列的谱图数远远小于其他两个软件,约只有0.05%,局部准确性较低(表1;表2)。而在HCD谱图中,Novor和p Novo3表现相当,具有8 aa及以上长度公共子序列的谱图比率达到50%及以上。
图表编号 | XD00186084800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.25 |
作者 | 成茜、杨筱韵、李婧 |
绘制单位 | 上海交通大学生命科学技术学院、上海交通大学生命科学技术学院、上海交通大学生命科学技术学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |