《表4 L8-1-2和L8-2-6-1特有的外显子突变位点数大于等于10的基因的分子功能》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《Pri-osa-miR164c转化介导水稻‘Kasalath’基因组和种子抗老化能力的变化》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

生物信息学分析表明，L8-1-2的外显子区域特有突变基因共664个（结果未列出），包含1 290个SNP和443个InDel突变，其中386个基因只发生SNP突变（共864个），147个基因只发生InDel突变（共193个），131个基因同时发生多个SNP（共426个）和InDel突变（共250个）；L8-2-6-1的外显子区域特有突变基因共651个（结果未列出），包含1 252个SNP和389个InDel突变，其中387个基因只发生SNP突变（共805个），123个基因只发生InDel突变（共155个），141个基因同时发生多个SNP（共447个）和InDel突变（共234个）。进一步分析表明，L8-1-2和L8-2-6-1的上述特有突变基因的非同义突变cSNPs编码氨基酸总数量分别为926和862个，且不同类型氨基酸的数目均存在差异（图5）；其中，L8-1-2和L8-2-6-1的单一基因外显子突变位点数≥10的特有突变基因分别有19和15个（图6）。通过UniProt数据库查询，这些突变基因的分子功能主要有ATP结合、氧化还原酶活性、丝氨酸/苏氨酸（Ser/Thr）蛋白激酶活性、其他蛋白激酶活性等类别，有的突变基因功能未知（表4）。L8-1-2和L8-2-6-1在ATP结合、Ser/Thr蛋白激酶活性及其他蛋白激酶活性类别上均有较多的相关功能基因的位点突变，但两者在其他分子功能类别上有明显差异，其中，L8-1-2特有突变基因的分子功能主要为参与磷脂分解代谢过程，与半胱氨酸型肽酶活性有关、参与蛋白质去磺酰化反应，参与铜离子结合以及丝氨酸蛋白酶抑制剂等；而L8-2-6-1特有突变基因的分子功能主要为与血红素、铁离子结合，碳固定，三羧酸循环反应及与多糖结合等。