《表4 黄颡鱼微卫星分布于外显子的基因GO富集》
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《黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)全基因组微卫星分布特征分析》
对微卫星进行定位,其中16 381个微卫星分布在外显子上,经统计共分布于3 853个基因中。基因的GO功能注释主要分为3大类,即生物学过程、细胞组分和分子功能。通过对外显子上包含微卫星的3 853个编码基因进行GO功能注释,共得585个GO条目。其中注释到细胞组分的条目最多,共274个,占比46.84%。主要包括膜整体组分(Integral component of membrane)、膜(Membrane)和核(Nucleus)等。189个GO条目注释到分子功能,占比32.31%。主要集中在参与蛋白质结合(Protein binding)、核酸结合(Nucleic acid binding)和G蛋白偶联受体活性(G-protein coupled receptor activity)等方面。122个GO条目注释到生物学过程,占比20.85%。主要与蛋白磷酸化(Protein phosphorylation)、转录调控(Regulation of transcription)和G蛋白偶联受体信号通路(G-protein coupled receptor signaling pathway)有关。但GO注释到分子功能的编码基因数最多(图2)。GO功能富集中最为显著的GO条目分别为电压门控钠通道复合物(p=2.02E-06)、电压门控钠通道活性(p=2.33E-06)和蛋白去磷酸化(p=2.37E-06)(表4)。
图表编号 | XD00196553800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.25 |
作者 | 徐杰杰、郑翔、李杰、尹绍武、王涛 |
绘制单位 | 南京师范大学海洋科学与工程学院、南京师范大学海洋科学与工程学院、南京师范大学海洋科学与工程学院、南京师范大学海洋科学与工程学院、南京师范大学海洋科学与工程学院 |
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