《表3 白及提取物-靶蛋白对接结果》

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《基于分子对接技术探讨白及提取物抗支气管哮喘作用机制研究》

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注:-表示该构象中不存在有氢键作用的氨基酸残基。

利用软件Auto Dock和PyMOL计算得到共100种对接结果。分析计算对接结果，当结合能的绝对值较大而抑制常数较小时，说明受体与配体之间的结合较好。由此共筛选了30组结果，如表3。可知3，3'，5-三甲氧基联苄与靶蛋白COX-2、ICAM-1、RANTES、TRAF-2、AP-1、MKK3结合较好；4，7-二羟基-2-甲氧基-9，10二氢菲与靶蛋白TAK-1、VACM-1、GM-CSF、p38-αMAPK、MKK6、COX-2结合较好；对羟基苯甲酸与靶蛋白NF-κB、IL-1β、ICAM-1、TNF-α、TRAF-2、MKK4结合较好；苹果酸与靶蛋白MKK4、MKK2、GM-CSF、VACM-1、COX-2、MKK6、TNF-α结合较好；对羟基苄胺与靶蛋白RANTES、AP-1、TRAF-2、MKK6、VACM-1、p38-αMAPK结合较好（表2、表3）。