《表1 荆门蜱病毒筛查引物》
取200μl蜱悬液,参照美国Invitrogen公司TRIzol LS Reagent和E.Z.N.A.RNA isolation Kit(OMEGA)说明书提取RNA。使用one step RT-PCR Kit(TaKaRa,中国大连)试剂盒进行样本RNA中JMTV和类JMTV节段1保守区(S1,主要编码RdRp)的PCR扩增。One step RT-PCR Kit扩增条件为:50℃30 min反转录总RNA为cDNA;94℃预变性3 min,94℃变性35 s,53℃退火35 s,72℃延伸30 s,共35个循环;72℃10 min。以第1轮产物为模板使用Taq DNA聚合酶(TaKaRa,中国大连)进行第2轮巢式PCR扩增。Taq DNA聚合酶扩增条件:94℃预变性3 min;94℃变性35 s,53℃退火35 s,72℃延伸30 s,共35个循环;72℃10 min。筛查引物参照文献[4](表1)。根据初筛结果进一步进行JMTV全基因组扩增。PCR产物用QIAquick Gel Extraction Kit(Qiagen,美国)纯化后送生工生物工程(上海)有限公司采用标准Sanger测序法直接测序,所有测序数据使用Seqman进行组装。
图表编号 | XD00180590100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.20 |
作者 | 余竹梅、熊衍文、王文、张永振 |
绘制单位 | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所人兽共患病室传染病预防控制国家重点实验室、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所人兽共患病室传染病预防控制国家重点实验室、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所人兽共患病室传染病预防控制国家重点实验室、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所人兽共患病室传染病预防控制国家重点实验室 |
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