《表2 新发现荆门蜱病毒的基因组信息》

《表2 新发现荆门蜱病毒的基因组信息》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《中国北方地区蜱携带荆门蜱病毒的分子流行特征分析》


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根据初筛阳性样本,通过RT-PCR扩增获得了4株接近全长的JMTV基因组序列,根据病毒的宿主和采样地点将这4株毒株分别命名为Bole-Hd-64、Bole-Hd-72、Changping-Ds-66和Shenyang-Hl-42(表2),其中前2株来自新疆的残缘璃眼蜱,后2株分别来自昌平区的中华革蜱和沈阳市的长角血蜱。利用MegAlign软件进行序列比对同源性分析,显示新发现JMTV4个片段之间核苷酸同源性为91.4%~99.8%,进一步分析可以看到,新扩增的JMTV在节段1、节段2和节段4都与已知的新疆啮齿类来源的JMTV同源性最高,达94.8%~99.8%,与来自中国其他地区的蜱源性JMTV同源性为90.1%~94.1%。然而节段3中的其中2株病毒(Bole-Hd-72和Shenyang-Hl-42)和新疆啮齿类JMTV同源性高达98.9%~99.1%,另2株(Bole-Hd-64和Changping-Ds-66)与中国其他地区的蜱源性JMTV同源性为91.6%~93.6%;新扩增的蜱JMTV与来自非洲、南美洲和欧洲的JMTV同源性为71.8%~92.3%,而与阿龙山病毒同源性相对较低(57.9%~74.2%)。