《表2 新发现荆门蜱病毒的基因组信息》
根据初筛阳性样本,通过RT-PCR扩增获得了4株接近全长的JMTV基因组序列,根据病毒的宿主和采样地点将这4株毒株分别命名为Bole-Hd-64、Bole-Hd-72、Changping-Ds-66和Shenyang-Hl-42(表2),其中前2株来自新疆的残缘璃眼蜱,后2株分别来自昌平区的中华革蜱和沈阳市的长角血蜱。利用MegAlign软件进行序列比对同源性分析,显示新发现JMTV4个片段之间核苷酸同源性为91.4%~99.8%,进一步分析可以看到,新扩增的JMTV在节段1、节段2和节段4都与已知的新疆啮齿类来源的JMTV同源性最高,达94.8%~99.8%,与来自中国其他地区的蜱源性JMTV同源性为90.1%~94.1%。然而节段3中的其中2株病毒(Bole-Hd-72和Shenyang-Hl-42)和新疆啮齿类JMTV同源性高达98.9%~99.1%,另2株(Bole-Hd-64和Changping-Ds-66)与中国其他地区的蜱源性JMTV同源性为91.6%~93.6%;新扩增的蜱JMTV与来自非洲、南美洲和欧洲的JMTV同源性为71.8%~92.3%,而与阿龙山病毒同源性相对较低(57.9%~74.2%)。
图表编号 | XD00180590200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.20 |
作者 | 余竹梅、熊衍文、王文、张永振 |
绘制单位 | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所人兽共患病室传染病预防控制国家重点实验室、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所人兽共患病室传染病预防控制国家重点实验室、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所人兽共患病室传染病预防控制国家重点实验室、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所人兽共患病室传染病预防控制国家重点实验室 |
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