《表1 甲、乙型流感病毒和鼻病毒检测引物》

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《EvaGreen多重荧光RT-PCR结合熔解曲线分析同时检测3种呼吸道病毒》


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系统分析Gen Bank数据库中的Flu-A、Flu-B和HRV的基因序列,首先用序列比对软件DNAMan 6.0进行同源性比对,在相对保守的基因区域用Oligo 7.0设计引物,尽量避开变异位点或采用简并碱基。在参考相关文献及国家流感中心公布的检测引物序列的基础上重新进行优化设计。Flu-A针对序列最保守和稳定的M基因(matrix protein)设计通用检测引物;Flu-B利用NS1基因(nonstructural protein 1)设计检测引物;HRV则参考文献针对5’NCR(非编码区)设计引物[11]。最后优化确定的引物序列如表1所示,引物由英潍捷基(上海)贸易有限公司完成。