《表1 安徽省猪毕氏肠微孢子虫流行情况》

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《安徽省猪毕氏肠微孢子虫分子特性及感染情况调查》


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随机测序的123个毕氏肠微孢子虫ITS基因经DNAMAN软件进行序列比对、加工,并在GenBank中进行Blast分析,显示均为毕氏肠微孢子虫ITS基因,剔除相同序列,共得到13个代表不同基因型的序列(序列已登录至GenBank,序列ID分别为MN158151-MN158163),包括6个已知的基因型(CS-4,CH5,CTS3,EbpA,CHS5和CHG23)和7个新基因型(AHP1、AHP2、AHP3、AHP4、AHP5、AHP6和AHP7),其中CS-4(44)、AHP1(18)、CH5(14)、CTS3(10)和EbpA(10)为优势基因型(表1)。构建的进化树见图2,13个ITS基因型均属Group 1,其中CHG23、CS-4、CH5、CTS3、AHP7、AHP3、AHP4和AHP6属于Group 1d,其余基因型属于Group 1e。