《表2 各功能区OTU聚类与多样性分析》

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《寒旱区湖泊沉积物中固氮微生物群落特征——以包头南海湖为例》


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覆盖率(coverage)是直接影响测定结果的重要原因,通常覆盖率可以直观的反应测序深度.由表2可见,本研究区域的4个采样点中的微生物覆盖率均达到99.90%以上,说明本次测序基本涵盖所有固氮微生物.同时,测序深度又直接影响覆盖率,当测序深度不足时就会导致微生物分析不完全的情况.寇文伯等[27]对鄱阳湖细菌进行高通量测序时,由于沉积物中细菌种群较多,当测序深度到达4000时稀释曲线仍然处于快速上升的阶段,测序结果中出现了由于测序深度不够而导致的沉积物微生物分析不完全的情况,为了避免此类问题发生,本研究将测序深度增加至20000,当测序深度达到7500以上时稀释曲线逐渐趋于平缓或达到平台期,表明测序深度已经基本覆盖到样品中绝大多数物种.