《表4 正交实验直观分析Table 4 Analysis of orthogonal experiment》

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《酸枣SSR-PCR反应体系优化》


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极差R值能反映出不同因子对PCR扩增效果的影响,极差越大说明该因子对PCR扩增效果的作用越大。由表4可知,影响酸枣SSR-PCR反应的各因素作用大小依次为dNTPs浓度、DNA模板、Taq酶、Mg2+浓度、引物浓度。各因素不同水平的作用效果由k值决定,k值越大效果越好。由表4可知,DNA模板、Mg2+浓度、dNTPs浓度、引物浓度、Taq酶用量分别以k2、k3、k1、k4和k1最大,所以酸枣SSR-PCR的最佳反应体系的理论值为DNA模板100 ng,Mg2+浓度1.5mmol·L-1,dNTPs浓度0.3 mmol·L-1,引物浓度0.5μmol·L-1,Taq DNA聚合酶0.5U。理论值与试验设计中最佳组合比较,二者在扩增效果影响最大的2个因素(dNTPs浓度、DNA模板)上最佳浓度相同,在引物浓度上相同,在Mg2+浓度上理论值高于试验设计的最佳组合值,在Taq DNA聚合酶上理论值低于试验设计的最佳组合值。但理论上的最佳体系的效果尚需进一步的试验进行检验,综合考虑,该研究选择6号组合作为酸枣SSR-PCR反应体系。