《表4 武昌湖湿地菰草环境根际土壤样本中优势菌种及其主要功能Table 4 Major bacteria and their functions of the rhizhosphere soil of

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《武昌湖典型退化湿地菰草根际微生物群落结构》

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注:带*号的细菌为科水平名称，其他均为属水平名称。

武昌湖菰草根际土壤细菌16S r DNA基因的高通量测序结果（表4）表明，具有降解烷烃、产醋酸和甲烷的厌氧绳菌科Anaerolineaceae[22]是根际土壤文库中第一类优势菌种，所占比例高达9.82%；作为文库第二大类的铁杆菌属Ferribacterium（6.44%）是一类专性异化厌氧菌，能够耦合醋酸盐和其他有机酸的氧化来实现三价铁还原，也可以降低栖息环境中硝酸和富马酸含量[23]。细菌Aminicenantes在文库中比例为4.3%，是一种能够生存于低氧压、低盐度和受烃类污染的各种极端复杂环境的微生物，在自然环境中丰度较高[24]。厌氧菌拟杆菌门Bacteroidetes文库比例为3.73%，广泛分布于土壤、沉积物和海水等环境中，往往能够降解纤维素等大分子的糖类物质。而文库中Chloroflexi（3.28%）是一类通过光合作用产生能量的细菌，Zanaroli等研究发现该类菌属在光合作用中不产O2，也不能固氮，但具有脱氯功能[25]。同时，专性化能自养的硫杆菌属Thiobacillus在文库中的比例为3.17%，研究表明Thiobacillus不仅可以氧化金属硫化物成硫酸盐，为植物提供可吸收的硫酸态硫素营养；同时，可以利用氧化过程释放的能量同化二氧化碳[26]。而化能好氧有机营养型Xanthomonadales占文库比例为2.77%，该类细菌具备较强的降解有机磷和芳香族化合物的能力[27]。自养型细菌Sideroxydans在该文库所占比例为2.50%，该菌属能够利用Fe2+氧化过程释放的能量实现CO2和氮固定，为共同生境中植物群落生长提供了潜在的碳源和氮源[28]。同时，细菌Anaeromyxobacter在文库中含量为2.36%，其不仅能够还原环境中高价铀、锰、铁等金属离子，而且具备氧化乙酸或氢等功能，为植物生长提供了良好环境[29]。文库中，兼性厌氧型细菌Sulfuritalea含量为2.27%，Kojima等[30]认为该类菌属可以氧化硫代硫酸盐、单质硫和氢等获取能量，通常生活在淡水湖泊的沉积物等缺氧区。分析发现红环菌科Rhodocyclaceae在文库中的比例为2.17%，该类微生物能够分解不同有机物获得碳源进行生存，其在环境有机污染物降解方面具有较好应用前景[31]。在文库中也存在严格厌氧的Syntrophaceae（2.06%）和兼性嗜氢好氧自养菌Hydrogenophilaceae（1.96%），前者在碳氢类化合物的厌氧降解过程中扮演重要角色[32]，后者则可以有效利用有机酸、氨基酸或蛋白胨氮源，具有一定的反硝化作用。