《表3 武昌湖湿地菰草环境根际水体样本中优势菌种及其主要功能Table 3 Major bacteria and their functions of the rhizosphere water of

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《武昌湖典型退化湿地菰草根际微生物群落结构》

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注:带*号的细菌为科水平名称，其他均为属水平名称。

武昌湖菰草根际水体细菌16S r DNA基因的高通量测序结果（表3）表明，Limnohabitans作为该文库中第一类优势菌属，其比例高达23.92%，而且Hahn等发现该菌属于化学有机营养的兼性厌氧微生物，广泛存在于淡水和湖泊中，具有同化乙酸盐、甘油酸盐和葡萄糖酸盐等功能[13]。第二类是广泛分布于土壤和水中的，典型有机化能营养型的好氧反硝化细菌———黄杆菌属Flavobacterium，该菌在文库中的比例为15.80%。而第三大类丛毛单胞菌属Comamonadaceae在文库中比列为7.74%，研究表明该菌属可用于活性污泥处理废水的脱氮除磷处理工艺，不仅能够将蛋白质分解成氨基酸，而且还能分解苯酚、有机酸和氨基酸[14]。化能自养型厌氧氨氧化菌属Candidatus占文库比例4.66%，其以二氧化碳作为唯一碳源，可将环境中氨氮转化成N2去除，对全球氮循环具有重要意义。鱼孢菌科Sporichthyaceae（4.16%），目前只有Sporichthya一个菌属，功能认识较少[15]。广泛分布于河流、湖泊和海湾等水体的蓝细菌属Cyanobacteria在文库中比例为4.10%，通常具备光合作用释放氧气的功能；同时，能够固定氮气提高土壤肥力，在氮磷丰富的水体中繁殖旺盛，可作为水体富营养化的指示生物，部分属种易引起赤潮或水华。而铁细菌属Crenothrix（3.73%）则是一类广泛生活在池塘、湖泊等水域中的化能自养型微生物，不仅能够氧化Fe2+至Fe3+，并同化利用二氧化碳；同时也参与磷代谢[16]。在根际水体也存在仅能以氨基酸作为碳源生活的需氧型化能异养菌Fluviicola（3.37%）[17]；也存在细胞氧化酶呈阳性的好氧型单胞菌属Pseudarcicella（3.29%）[18]。与此同时，具有还原三价铁和氧化二价锰作用的Albidiferax（2.72%）[19]，以及氧化酶和过氧化氢酶呈阳性的需氧型铁氧化细菌Sediminibacterium（2.22%）在水体文库中也客观存在[20]。广泛存在于湖泊、淡水沉积物和沼泽中的严格好氧的，能够以甲烷、甲醇等含甲基单碳化合物作为碳源和能源的Methylomonas[21]在菰草根际水体中也占有一定丰度。