《表5 武昌湖湿地菰草环境湖泊沉积物样本中优势菌种及其主要功能Table 5 Major bacteria and their functions of the lake sediment of Zi

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《武昌湖典型退化湿地菰草根际微生物群落结构》

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注:带*号的细菌为科水平名称，其他均为属水平名称。

武昌湖湖泊沉积物细菌16S r DNA基因的高通量测序结果（表5）表明，酸杆菌科Acidobacteriaceae细菌是该文库中第一类优势菌种，所占比例为10.64%，大多数细菌具有嗜酸性，目前对其功能认识较少，在环境中可能具有重要作用。文库第二大类的硝化杆菌Latescibacteria比例为6.24%，该类微生物能够氧化氨或亚硝酸获得能量，并能以CO2为唯一碳源进行生长代谢。作为重要的氨氧化细菌，Nitrosomonadaceae在文库中占有较高比例（6.12%），其广泛分布于土壤、淡水和海水中，能在有氧条件下将氨氧化成亚硝酸，对水体氮污染的去除具有重要作用[33]。同时，分析发现硝化螺旋菌属Nitrospira在文库中比例较高（5.57%），该细菌能氧化亚硝酸盐成硝酸盐，在水体净化和氮循环中发挥着重要作用[34]，而且，对水生植物非常重要，如果缺少，氨氮、硝酸盐、亚硝酸盐等循环体系将被中断，导致水生环境破坏。与此同时，文库中存在大量的螺旋体属细菌Spirochaeta（5%）和Parcubacteria（3.86%），前者是一种专性厌氧菌，能利用纤维二塘、淀粉等作为碳源[35]，而后者一般生长于厌氧环境中，并能参与缺氧环境氢和硫的循环，但却不能合成氨基酸、核苷酸和纤维素等[36]。Saccharibacteria细菌在文库中比例为3.23%，通常具有降解纤维素、甲壳素等多糖的功能[37]。而厌氧氨氧化菌Candidatus在文库中的比例为3.21%，该细菌可以在缺氧条件下利用亚硝酸根（NO2-）将铵离子（NH4+）氧化为氮气，对全球氮循环具有重要意义[38]。黄杆菌科Xanthobacteraceae在文库中的比例为3.12%，该类细菌通常具有固氮功能，而且部分能进行氢和硫代谢，同时，一些种属还具有降解烷烃、烯烃和多环芳烃的功能。化学有机营养型细菌Bryobacter在文库中所占比例为2.80%，能利用果糖、葡萄糖和乳糖等碳源，以及氨氮、硝酸盐氮等氮源进行生长代谢，但是不能利用大多数有机酸[39]。同时，分析表明地杆菌属Geobacter在文库中也占有一定比例（2.11%），该厌氧细菌能够以乙醇作为唯一碳源进行物质代谢，具有氧化有机物和重金属能力[40]。