《表1 9种真菌中BBP的信息》

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《9种真菌中分支点结合蛋白的生物信息学分析》


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首先通过真菌数据库获取稻瘟病菌BBP的蛋白ID及氨基酸序列,然后通过NCBI进行同源比对,获取酿酒酵母、小麦全蚀病菌、粗糙脉孢菌、西瓜炭疽病菌、白僵菌、尖孢镰刀菌、水稻恶苗病菌、立枯丝核菌中BBP的蛋白ID、蛋白长度、基因座位、覆盖度及E值(表1)。其中,稻瘟病菌BBP的蛋白长度最大,氨基酸数目为638;酿酒酵母BBP的蛋白长度最小,氨基酸数目为458。除稻瘟病菌外,白僵菌BBP的覆盖度最高,为96%,E值为0;酿酒酵母BBP的覆盖度最低,立枯丝核菌次之,分别占比41%和67%,E值分别为1.00E-96和4.00E-135。