《表4 9种真菌中BBP蛋白质空间结构比对分析与质量评价》

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《9种真菌中分支点结合蛋白的生物信息学分析》


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蛋白质功能与其高级结构密切相关,为了进一步明确9种真菌中BBP的生物学功能,本研究利用ExPASy中的Swiss Model在线软件对BBP进行三级结构预测获取3D结构图以及相关信息。由表4可知,XP_008603189.1和CCO28600.1模板为4wan.1.A,其余7种真菌中BBP模板均为4wal.1.A,其中,ONH80283.1与模板的一致性最高,达97.66%,建模质量评分最高为0.23,建模质量评分表示为0~1之间的数字,数字越大可靠性越高,由此可知,该模型具有较高参考价值。由图3可知,XP_003709462.1、XP_009226994.1、XP_961266.1、TDZ21617.1、XP_008603189.1、RKK80992.1以及KLO90296.1的3D结构非常相似,推测BBP在这7种真菌中高度结构保守,功能相似;ONH80283.1分子量最小,结构相对较简单,而CCO28600.1以四聚体形式存在,推测其可能以四聚体形式发挥功能,这与系统进化分析中ONH80283.1与CCO28600.1独立构成分支的结果具有一致性。