《表2 潜在治疗靶点的网络拓扑属性表》
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《基于网络药理学研究薄荷活性成分治疗慢性胆囊炎的作用机制》
将上述作用靶点导入String数据库,限定物种为人,获取蛋白相互作用关系,以TSV格式保存其结果。保留node1、noe2、Combined score信息,将这三个信息导入Cytoscape软件绘制蛋白相互作用网络图,见图3,并进行网络拓扑属性分析,见表2。图中节点表示靶点,边表示靶点之间的联系,由图3可见,蛋白互作网络共涉及38个节点,266条边(其中PRSS1,CHRM3与其它靶点无相互作用,故没有在网络中体现)。节点的大小和颜色表示Degree值的大小,节点越大,颜色逐渐变深对应的Degree值越大。边的粗细表示Combine score,边越粗Combine score越大。经计算后可知,平均连接度约为14,平均最短路径长度约为1.71,平均介数约为0.02,平均聚类系数约为0.7。具有高度值(连接度)和介数中心的靶点可被认为是中心靶点,在此网络中,度值和介数中心均超过平均值的有10个,分别是EGFR、MYC、CASP3、CCND1、VEGFA、ERBB2、MDM2、ESR1、IL6、PPARG,可认为这10个是薄荷治疗慢性胆囊炎的关键作用靶点。
图表编号 | XD00166867600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.30 |
作者 | 孔丽、左华江、吴春凤 |
绘制单位 | 广西医科大学附属柳州市人民医院、广西科技大学、广西科技大学、广西医科大学附属柳州市人民医院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |