《表3 柴芩清宁胶囊治疗上呼吸道感染的潜在靶点拓扑学参数》
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《基于网络药理学的柴芩清宁胶囊治疗上呼吸道感染的机制》
注:DC、EC、IC、LAC、BC、CC、NC均为拓扑学参数
囊治疗上呼吸道感染的潜在靶点挖掘首先,运用数据库将柴芩清宁胶囊活性成分靶基因与上呼吸道感染的相关靶基因进行PPI网络的构建,并取交集,得到柴芩清宁胶囊治疗上呼吸道感染的互作网络靶标合集,56个靶点共形成986条蛋白互作关系,其中673条互作关系≥0.9,为置信度高的互作对。对该网络中的node运用插件CytoNCA计算网络中拓扑学参数(DC、NC、IC、CC、BC、EC、LAC),各参数越高说明该基因在网络中占有越重要的地位,以各参数均>2倍所有node的中位数为筛选条件,筛选出网络中重要的node共18个,作为柴芩清宁胶囊治疗上呼吸道感染的潜在的、发挥关键作用的靶点,见表3。分析这些关键基因,大部分基因都参与炎症反应,如AKT1、IL-6、IL-10、IL-1B、IL-8、IL-2、TNF等[10-12];CCL2、ICAM-1趋化细胞的迁移,刺激炎症细胞的释放[13-14];CASP8、CASP9、TGFB1、STAT1、CASP3等参与细胞的生长、分化及凋亡,同时有免疫调节作用[15-17];TP53、SERPINE-1抑制肿瘤、帮助细胞基因修复缺陷[18-19];MMP-9参与改变血管通透性[20];CD40LG调控基因表达与免疫应答[21]等。提示,柴芩清宁胶囊可能通过作用于这些关键靶基因,影响其参与的生物过程,达到对抗上呼吸道感染的作用。2.4柴芩清宁胶囊治疗上呼吸道感染的潜在靶点GO富集分析和KEGG富集分析运用在线工具Omicshare,将柴芩清宁胶囊治疗上呼吸道感染的潜在靶点进行GO富集分析发现,预测靶点在“生物过程”中,主要富集于调节细胞代谢、细胞免疫、应激反应和细胞黏附等过程;在“细胞组成”研究中,主要影响细胞外基质、细胞膜和吞噬小体;在“分子功能”中,主要富集于蛋白结合、酶活力、信号转导及转录因子活性等方面。见图2。
图表编号 | XD00149101800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.20 |
作者 | 唐铖、徐瑾、李朝娟、黄雅菊 |
绘制单位 | 南京中医药大学附属中西医结合医院呼吸科、南京中医药大学附属中西医结合医院呼吸科、南京中医药大学附属中西医结合医院呼吸科、南京中医药大学附属中西医结合医院呼吸科 |
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