《表2 靶点网络的拓扑学性质》
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《基于指纹图谱和网络药理学对当归四逆汤中桂枝的Q-marker预测分析》
将筛选出的116个靶点,导入在线STRING 11.0数据库软件(https://string-db.org/cgi/input.pl)进行PPI网络分析,选择物种为“Homo sapiens”,蛋白交互参数评分值为“high confidence>0.7”,隐藏网络中无联系的节点,其余参数设置不变,获得核心靶点PPI网络图(图4),结果共获得116个节点,199条边。将PPI结果以TSV文本格式导入Cytoscape 3.7.1软件中,并利用Cytoscape 3.7.1软件中的“Network Analyzer”功能对PPI网络进行拓扑属性分析,计算选取“度值”(degree),“介数中心性”(betweenness centrality)和“接近中心性”(closeness centrality)3个重要拓扑参数均大于中位数且degree≥9的靶点作为核心靶点。经筛选得到12个核心靶点,结果见表2。经分析发现,这12个靶点与肉桂酸、2-甲氧基肉桂酸、2-甲氧基桂皮醛、桂皮醛、香豆素和原儿茶酸6个成分有关。
图表编号 | XD00178408100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.28 |
作者 | 夏金鑫、梅茜、郭爽、严国俊、王巧晗、季德、赵晓莉、陆兔林、毛春芹 |
绘制单位 | 南京中医药大学药学院、南京中医药大学药学院、南京中医药大学药学院、南京中医药大学药学院、南京中医药大学药学院、南京中医药大学药学院、南京中医药大学药学院、南京中医药大学药学院、南京中医药大学药学院 |
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