《表2 Unigenes注释结果》
以CDD、KOG、NR、NT、GO、Swissprot、PFAM、KEGG、Tr EMBL这9个数据库作为参考,将de novo组装得到的71 463个基因序列与之进行比对和注释(见表2)。注释到CDD、KOG、NR、NT、PFAM、Swissprot、Tr EMBL、GO、KEGG数据库种的Unigenes分别有19 526、13 110、39 621、38 769、14393、24 163、39 653、29 309和3 679条,注释到CDD数据库种的Unigenes最多,占比27.32%,而注释到KEGG数据库的Unigenes最少,占5.15%。在9个数据库中至少1个数据库注释成功的Unigenes为47 624条,占总Unigenes数的66.64%;共有2 415个Unigenes与9个数据库都能匹配成功,占总Unigenes数的3.38%(见表2);另外,尚未注释成功的Unigenes数量较多,有23 839条,约占1/3。
图表编号 | XD00166429300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.01 |
作者 | 张雨、夏铭泽、张发起 |
绘制单位 | 中国科学院高原生物适应与进化重点实验室中国科学院西北高原生物研究所、中国科学院大学、中国科学院高原生物适应与进化重点实验室中国科学院西北高原生物研究所、中国科学院大学、中国科学院高原生物适应与进化重点实验室中国科学院西北高原生物研究所 |
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