《表2 Unigenes注释结果》

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《药用资源植物山莨菪的转录组信息分析》


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以CDD、KOG、NR、NT、GO、Swissprot、PFAM、KEGG、Tr EMBL这9个数据库作为参考,将de novo组装得到的71 463个基因序列与之进行比对和注释(见表2)。注释到CDD、KOG、NR、NT、PFAM、Swissprot、Tr EMBL、GO、KEGG数据库种的Unigenes分别有19 526、13 110、39 621、38 769、14393、24 163、39 653、29 309和3 679条,注释到CDD数据库种的Unigenes最多,占比27.32%,而注释到KEGG数据库的Unigenes最少,占5.15%。在9个数据库中至少1个数据库注释成功的Unigenes为47 624条,占总Unigenes数的66.64%;共有2 415个Unigenes与9个数据库都能匹配成功,占总Unigenes数的3.38%(见表2);另外,尚未注释成功的Unigenes数量较多,有23 839条,约占1/3。