《表2 Unigenes注释统计表》

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《美国红枫叶片转录组分析》


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COG:直系同源群;GO:基因本体论;KOG:真核生物同源组;Pfam:蛋白家族;Swiss-Prot:Swiss-Prot蛋白质序列数据库;egg NOG:egg NOG数据库;NR:非冗余数据库;下同

将全部unigenes序列与COG、GO、KEGG、KOG、Pfam、Swiss-Prot、eggNOG以及NR 8个数据库进行比对(表2;表3),结果显示48 387条unigenes获得了注释信息,其中长度在1 000 bp以上的基因注释效率为42.19%,而30 185条unigenes(38.42%)未获得注释信息,为美国红枫呈色机理、抗逆性等后续实验提供了理论基础。