《表2 肾纤维化关键靶蛋白及其RMSD值》
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《基于网络药理学探究大黄、姜黄配伍治疗肾纤维化的作用机制》
分子对接可靠性验证显示,所选用的关键靶蛋白都较可靠,可用于虚拟筛选(见表2)。通过Lipinski类药性五原则和分子对接评价后,依据对接成功靶蛋白数≥2且-cdocker energy≥0共筛选出5个分子(见表3),其中有4个分子与各个关键靶蛋白有强烈的相互作用。以大黄酸作为配体,Casp-3作为受体为例,大黄酸的羧基与GLN 161和ARG 64之间形成氢键,构成一个氢键网络,同时与ARG 207的胍基之间形成Pi-cation相互作用(见图4、图5)。Caspases被认为目前已知最具特异性的蛋白水解酶的原因在于GLN 161、ARG 64和ARG 207之间强烈的氢键作用[7]。上述结果提示大黄、姜黄配伍治疗肾纤维化可能通过泽兰黄醇素、大黄酸等活性成分及Casp-3、ER、PR等蛋白起作用。
图表编号 | XD00163767200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.20 |
作者 | 黄晓丹、吉春兰、吴禹池、林嘉荣、林启展、刘旭生、卢钊宇、邹川 |
绘制单位 | 广州中医药大学第二临床医学院、广州中医药大学第二临床医学院、广州中医药大学第二附属医院透析科、广州中医药大学第二附属医院透析科、广州中医药大学第二附属医院透析科、广州中医药大学第二附属医院肾病科、广州中医药大学第二附属医院肾病科、广州中医药大学第二附属医院透析科 |
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