《表5 构建Colletotrichum系统发育树所用菌株信息》

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《马比木内生刺盘孢属真菌的分布多样性》

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备注：“T”代表模式菌株；“–”GenBank未公布相关序列

采用ITS、TUB2、ACT及GAPDH 4个基因联合的方法对选择的代表菌株进行系统发育学分析，了解其分子多样性和分类地位。将测序得到的结果，通过BioEdit软件进行质量评估，ContigExpress软件拼接，根据近期发表的权威文献，从NCBI数据库中下载所需参考菌株序列（表5）。与测序得到的序列通过在线服务器MAFFT v.7.110(Katoh&Standley 2013）进行比对。将处理好的单基因序列通过SequenceMatrix软件拼接（Vaidya et al.2011），拼接后的数据集采用最大似然法Maximum Likelihood(ML）树或贝叶斯法Bayesian Inference(BI）进行系统发育分析。系统发育树通过FigTree v 1.4.0、Microsoft Office PowerPoint 2016和Adobe Photoshop CS6(Adobe Systems，USA）编辑。