《表6 系统发育树构建序列来源》

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《基于线粒体细胞色素b的秋刀鱼种群遗传结构的研究》

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从本次实验中的145条序列中通过比对分析选取代表性的21条序列，通过在Genbank中查阅下载9条秋刀鱼序列作为外群序列，利用这30条序列构建系统发育树（图4），并且标注构建系统发育树的序列来源（表6）。由图4发现系统发育树形成两个谱系，谱系1为本文中选取的21条代表性序列，这21条序列分别来自WP1～WP4四个采样区域中，谱系2为Genbank下载的9条外群序列，通过系统发育树发现谱系1和谱系2都不存在明显地理分支，系统发育树整体显示谱系1与谱系2之间地理分化也不明显，亲缘关系较近。联系下载序列的相关文献可得这9条秋刀鱼序列来自西北太平洋，将本研究中的秋刀鱼序列与Genbank下载的秋刀鱼序列进行比对分析，发现本研究与下载的序列之间的相似度高达91%，通过研究可以发现西北太平洋海域秋刀鱼遗传多样性较低，遗传分化水平较小，亲缘关系较近，可能来自同一种群。通过对本文中15个单倍型构建单倍型网络图，单倍型网络图围绕H1呈星状拓扑型结构，也证明地理分化不明显，亲缘关系较近，种群差异性小。