《表1 GenBank与GISAID获取SARS-CoV-2基因组汇总》

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《新型冠状病毒种内变异及进化研究》

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下载GenBank与GISAID数据平台截至2020年4月5日的新型冠状病毒全基因组序列3973条，去除低质量序列，并将超过100株的国家随机选取20%的毒株，最终得到727株序列用于数据分析，共包括52个国家和地区（表1）。分别使用MAFFT软件7.450[14]进行多序列比对，FastTree软件[15]运行Jukes-Cantor+CAT模型构建进化树，iTOL[16]在线服务器将地理信息按颜色对进化树进行注释。