《表1 不同类型常见变异和罕见变异的数量及占比》
HGMD.Human Gene Mutation Database;GTEx.Genotype-Tissue Expression;GWAS Catalog.genome-wide association study catalogue;常见变异.MAF≥1%;罕见变异.MAF<1%
随后我们系统比较致病性变异、性状相关变异、表达调控型变异3类功能性变异位点在基因组不同功能区域的分布特点。以国际千人基因组计划中注释的MAF为基准,将HGMD(致病性变异)、GWAS Catalog(性状相关变异)、GTEx(表达调控型变异)3个数据库中收集的遗传变异分为常见变异(MAF≥1%)和罕见变异(MAF<1%),分析了这3类功能性变异位点中常见变异与罕见变异的分布模式,其数量和比例的统计结果见表1。
图表编号 | XD00163366900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.25 |
作者 | 李磊、路浩、卢一鸣、周钢桥 |
绘制单位 | 南京医科大学公共卫生学院流行病学系、南京医科大学公共卫生学院全球健康中心、军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)、军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)、南京医科大学公共卫生学院流行病学系、军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)、南京医科大学公共卫生学院全球健康中心 |
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