《表2 交叉取交集SNP结果》
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《PC4基因启动子区多态性与结直肠癌发病风险的关联研究》
SNP数据库(NCBI)中在PC4启动子区共检索到48个符合要求的SNP位点。以SNP2TFBS在线工具对SNP(NCBI)数据库中检索到的48个SNP位点进行功能预测,结果提示有19个SNP位于转录因子识别区;以SNPinfo Web Server在线工具对SNP(NCBI)数据库中检索到的48个SNP位点进行功能预测,结果提示有3个转录因子识别区;以MAPPER2在线工具对SNP(NCBI)数据库中检索到的48个SNP位点进行功能预测,结合SNP2TFBS、SNPinfo和MAPPER2 3个数据库输出结果,对PC4基因启动子区的SNP进行精细定位、是否具有影响PC4转录的可能性及分型方法的可行性等进行系列生物信息学分析后,最终确定PC4基因启动子区的rs2008245、rs116123859、rs11555314、rs6891588、rs10061905、rs182519875和rs368305438共7个SNP位点作为候选分析的靶标位点(表2)。将7个SNP位点输入LDlink在线工具进行连锁不平衡检测,界定连锁不平衡检测参数R2=0.80、D’=1.00,结果提示各候选SNP位点两两间相互均不连锁。
图表编号 | XD0016035900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.05.30 |
作者 | 陈维艳、龙琦、王灵巧、向梦龙、杨桓、曹佳、周紫垣 |
绘制单位 | 陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系军事环境卫生学教研室、陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系军事环境卫生学教研室、陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系军事环境卫生学教研室、陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系军事环境卫生学教研室、陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系毒理学研究所、陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系毒理学研究所、陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系军事环境卫生学教研室 |
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