《表两个显著失调的circRNAs》

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《成人隐匿性自身免疫性糖尿病患者环状RNA差异性表达分析》

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高通量测序共发现992个差异性表达的circRNAs，其中209个表达上调，上调倍数最大2.88；783个表达下调，下调倍数最大2.95。这些circRNAs广泛存在于各个染色体，包括X染色体和Y染色体（图1）。其中大多数差异性表达的circRNAs来自外显子（图2）。散点图显示两组间差异有统计学意义的circRNAs，图中X轴和Y轴是样本的log2按比例分组的平均归一化信号值，黑线是折叠式变化线，红点表示上调，绿点表示下调，紫点表示无差异，默认倍数变化阈值是2.0。散点图表达了circRNA表达水平在NC、LADA组间变化超过1.5倍（图3）。通过分层聚类分析产生热图进一步显示两组间表达上调和下调的circRNAs，表达值由颜色刻度表示，强度从绿色（相对低表达）增至红色（相对高表达）。每一列表示一个组织样本，每一行表示1个circRNA（图4）。根据下列条件，选定目标circRNAs进行qRT-PCR实验：（1）基本参数，差异倍数>1.5，P<0.05；(2）外显子来源方便后续开展功能研究；（3）结合文献，从而选定所需circRNAs。经筛选和比对挑选出符合标准的2个circRNAs，其中1个为新circRNA，尚未在circBase或circ2Traits数据库中标注，根据圆环txStart基因组坐标，将其命名为hsa＿circ＿100670302，上调倍数为2.64；另1个为hsa＿circ＿0035809，下调倍数为2.68。（表2）。