《表1 差异表达最显著的10个circRNA》

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《基于第二代DNA测序技术的肺腺癌相关环状RNA生物信息学分析》

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FC:Fold change.

本次测序共检测到38 018种circRNA，其中内含子组成的套索型为1 020种，全外显子型为36 998种；有显著表达差异的circRNA共482种，其中70种circRNA显著上调，412种circRNA显著下调（图2A）。circRNA的差异表达火山图如图2B所示，聚类分析热图如图2C所示，上调与下调最明显的5种circRNA如表1所示。利用Target scan和miRanda对上调最明显的hsa＿circ＿0003999和hsa＿circ＿0139252及下调最明显的hsa＿circ＿0005101和hsa＿circ＿0124554进行miRNA及mRNA预测，综合2种预测软件的评分，每种circRNA选取相关系数最高的4种miRNA和20种mRNA；同时结合人工搜索PubMed及中国知网等数据库的方式，补充了11种在不同类型疾病中被报道的有miRNA-mRNA靶向关系但在2款预测软件中评分较低或未在2款预测软件中出现的mRNA。筛选结果如图3所示，miR-211-5p为靶点最多的miRNA。多项研究表明，miR-211-5p对肺癌[8]、乳腺癌[9]、肝癌[10]和宫颈癌[11]等恶性肿瘤的发生和发展起到了重要的调控作用。RAB22A为靶向关系最多的mRNA，其作为RAS致癌基因家族成员，它可以对正常细胞的增殖和分化起重要调节作用。据报道，结肠癌[12]、骨肉瘤[13]和肝癌[14]等多种恶性肿瘤的发生和发展均与RAB22A相关。