《表3 不同物种靶序列区域上下游引物比对结果》

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《高通量二代测序基因条形码技术在动物源性制品物种鉴定中的应用》


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注:表中带下划线区域为通用引物结合区域。

在理论上,利用在线生物信息学分析软件(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)进行序列搜索和比对。结果表明,该引物能有效扩增常见哺乳动物、鸟类和鱼类的核酸。扩增出的不同物种的序列位置如表3所示。另一方面,为了验证引物在实际应用中的适用性,对实验室保存的哺乳动物、鸟类、鱼类和植物等常见物种特异性DNA样本进行了扩增。琼脂糖电泳结果显示,所有样品均获得了明亮单一的扩增条带,相似的灰度表明各物种核酸扩增效率基本相似,未见非特异性扩增(图1)。实验结果说明设计的通用型引物对不同动物基因组中的靶基因具有较好的适用性。与已经报道的通用引物[25]相比较,本研究中设计优化的引物在保证了高效扩增效率和较好适用范围的前提下,为后续测序片段比对工作提供了更为丰富的序列信息,有助于提高物种鉴定的分辨率。