《表3 ELOVL2基因编码蛋白的氨基酸组成》

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《静原鸡ELOVL2基因多态性及其生物信息学分析》

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利用Bioedit软件预测静原鸡ELOVL2编码产物的理化性质、氨基酸组成（表3）。静原鸡ELOVL2蛋白的原子组成为C1638H2444N394O406S15，分子质量为34.63 kD，理论等电点为9.40。共有14个负电荷残基（Asp+Glu）和27个正电荷残基（Arg+Lys），其中半胱氨酸和天冬氨酸（Cys，Asp）数目最少，分别占整个氨基酸的2.0%，亮氨酸（Leu）数目最多，占整个氨基酸组成的12.5%。不稳定指数为35.36，脂肪指数为96.53，平均亲水性为0.247。蛋白的疏水性预测结果表明（图6），第246位缬氨酸（Val）疏水性最强（最高分值2.922），第57位赖氨酸（Lys）亲水性最强（最低分值-2.189），因此ELOVL2蛋白有较强的亲水区域（Score<-2）。TMHMM 2.0程序分析ELOVL2蛋白质的跨膜区（图7），结果显示ELOVL2蛋白质存在7个跨膜结构，分别位于29～51、68～90、116～135、142～164、179～201、208～225和235～254。用SignalP4.0程序预测ELOVL2蛋白的信号肽（图8），发现Y-Score曲线无峰值，S-Score=0.083，表明ELOVL2蛋白可能不存在信号肽序列。D-Score=0.102<0.45，为非分泌型蛋白。运用NetPhos 2.0 Server对蛋白磷酸化进行预测，可知静原鸡ELOVL2蛋白可能有13个丝氨酸（Ser）磷酸化位点，分别位于34、63、79、104、139、140、177、190、194、222、239、262和292位（图9），有5个苏氨酸（Thr）磷酸化位点，分别为38、206、256、269和273位，有3个酪氨酸（Tyr）磷酸化位点，分别为198、253和279位。