《表1 台湾金线莲和福建金线莲RNA-seq通量与质量》
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《两种金线莲全长转录本的构建及密码子使用偏好性分析》
对RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq)结果的分析表明,从台湾金线莲和福建金线莲的cDNA样品中,分别得34 742 855和29 213 781条150 bp的原始读长(Raw reads),包含过滤前碱基数(Raw bases)10.42 Gb和8.76 Gb。经质量检测和质量过滤,分别获得32 836 885和27 597 990条高质量读长(Clean reads),包含过滤后碱基数(Clean bases)9.85 Gb和8.28 Gb。测序错误率在1%以下的序列比例,即Q20值,大于96%;测序错误率在0.1%以下的序列比例,即Q30值,大于90%(表1)。据此可知,RNA-seq测序的通量和质量较高,满足后续分析需求。
图表编号 | XD00152918400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.28 |
作者 | 杨琳、瞿静涛、李晚忱、付凤玲、于好强、张君诚 |
绘制单位 | 三明学院药用植物开放利用福建省高校工程研究中心、四川农业大学玉米研究所、四川农业大学玉米研究所、四川农业大学玉米研究所、四川农业大学玉米研究所、四川农业大学玉米研究所、三明学院药用植物开放利用福建省高校工程研究中心 |
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