《表2 台湾金线莲和福建金线莲密码子使用频率》
提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《两种金线莲全长转录本的构建及密码子使用偏好性分析》
注:*:高频密码子
对台湾金线莲和福建金线莲RNA-seq分别拼接注释过滤后,使用自编程序进行密码子识别,得到6条可能的氨基酸序列中的1条氨基酸序列在Swiss-Prot数据库中比对得分远高于其他5条序列。分别获得台湾金线莲和福建金线莲1 497 038个和2 977 669个密码子。基于此,本研究统计了台湾金线莲和福建金线莲密码子使用频率(表2)。结果显示,相对密码子的使用频率(RSCU)值大于1.5或相对频率占60%以上的高频密码子(*表示高频密码子),在台湾金线莲中有:GAU、UGC;在福建金线莲中有:AGA、AAU、GAU、CAU、UCU、UAU。偏好的密码子中,87.5%均以A/T碱基结尾。
图表编号 | XD00152918200 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2020.06.28 |
作者 | 杨琳、瞿静涛、李晚忱、付凤玲、于好强、张君诚 |
绘制单位 | 三明学院药用植物开放利用福建省高校工程研究中心、四川农业大学玉米研究所、四川农业大学玉米研究所、四川农业大学玉米研究所、四川农业大学玉米研究所、四川农业大学玉米研究所、三明学院药用植物开放利用福建省高校工程研究中心 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |