《表4 花生属种间杂交多倍化过程中TDFs功能预测》
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《花生栽野种间杂交异源多倍化早期世代基因表达变化分析》
注:M:父本特有;F:母本特有;N:后代新增;a:亲本条带在后代所有材料中丢失;b:亲本条带在后代部分材料中丢失;n:后代材料中新出现的条带
选取35个大小在500~2 000 bp之间、重复性好且清晰的TDFs(transcripts derived fragments)进行克隆测序,并在NCBI数据库进行同源性比对和分析。结果显示,有27个TDFs序列与该数据库已登入的基因表现出较高的同源性(表4),来自父本、在后代材料中发生沉默表达的11个基因片段中,6个与未知功能蛋白相关、2个与抗逆相关、2个与转录因子相关、1个与能量与物质代谢相关;来自母本、在后代沉默表达的3个基因片段,2个与抗逆相关、1个与物质代谢相关;新增的13个TDFs中,5个与能量和物质代谢相关、4个与抗逆相关、4个与未知功能蛋白相关。按其功能分,抗逆相关基因有10条、未知功能蛋白相关基因8条、能量与代谢相关基因7条和转录因子相关基因2条(表5),分别占总数(27个TD-Fs)的37.04%、29.63%、25.93%和7.41%。这些研究结果表明,在花生栽野种间杂交异源多倍化早期,各世代发生沉默或激活表达的基因类型多样(包括4个类型),虽然抗逆相关和能量代谢相关基因占多数,但没有特别明显的倾向性。
图表编号 | XD00152826500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.28 |
作者 | 高忠奎、熊发前、韩柱强、蒋菁、黄志鹏、唐秀梅、吴海宁、钟瑞春、刘菁、唐荣华、贺梁琼 |
绘制单位 | 广西农业科学院科研基地管理处、广西农业科学院经济作物研究所、广西农业科学院经济作物研究所、广西农业科学院经济作物研究所、广西农业科学院经济作物研究所、广西农业科学院经济作物研究所、广西农业科学院经济作物研究所、广西农业科学院经济作物研究所、广西农业科学院经济作物研究所、广西农业科学院经济作物研究所、广西农业科学院经济作物研究所 |
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