《表2 11个基因组中CC/TIR抗病基因与多倍化关联基因数量统计》

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《豆科抗病基因NBS-LRR进化的多基因组比对分析》

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注:数据表示CC/TIR结构域抗病基因与加倍事件关联基因数目及占总数的比率

全基因组加倍有利于抗病基因家族拷贝数的扩增，为家族基因序列和功能多样化提供了材料来源。用NBS-LRR的两类抗病基因集搜索由全基因组加倍过程中产生的重复基因集，可得到每类基因集与加倍事件相关联的基因数量（表2）。抗病基因在每个基因组中，都存在大量的基因与不同的加倍事件相关联，不同的全基因组加倍对基因拷贝数的影响不同。每个基因组中CC域抗病基因与ECH关联的比率为2.8%～36.0%，最多的是鹰嘴豆，有36.0%都与ECH关联（处于ECH加倍产生的染色体重复区域），即可能是由ECH加倍产生，并保留在了现代基因组中；TIR域抗病基因与ECH关联的比率略低为2.4%～30.0%，最多的也是在鹰嘴豆中有30.0%的基因是与ECH关联。豆科共有加倍（LCT）相对于ECH更多的影响了家族基因拷贝数的变化，CC域抗病基因与LCT关联的比率为4.9%～63.8%；TIR域抗病基因与LCT关联的比率为1.3%～40.6%，CC域抗病基因数目比TIR几乎在每个基因组中高出一倍，如在花生A基因组中CC域抗病基因有30.6%与LCT关联，是TIR与LCT关联比率的2.1倍。但是木豆基因组中的抗病基因与LCT关联的比率并没有表现出增加，反而是减少；相类似的情况也存在于赤小豆基因组中，这可能是由基因组拼接造成的；在大豆特异性加倍（SST）之后，抗病基因中有超过50%与最近全基因组加倍关联，其中CC结构域有72.1%（528/732），TIR结构域基因有60.3%（114/189）。上述结果表明全基因组加倍对于家族基因拷贝数变化有着重要的影响，并且不同全基因组加倍对家族拷贝数变化影响不同，同一加倍事件对不同结构域抗病基因影响不同。